با توجه به ممنوعیت انتقال دانشجویان مقاطع تحصیلات تکمیلی، تصمیم گیری در خصوص انتقال این دسته از دانشجویان طبق روال سنوات گذشته به عهده کمیسیون موارد خاص انتقال دانشجویان مقاطع کارشناسی ارشد و دکترای تخصصی (PhD) وزارت متبوع، خواهد بود.

لازم به توضیح است در دانشگاه هایی که سامانه در موعد مقرر فعال نیست، مسئولیت به عهده همان دانشگاه بوده و از ارجاع هرگونه مکاتبه اداری و یا دانشجو به وزارت متبوع جهت اخذ مجوز خارج از سامانه خودداری گردد.